09.09.2026
Lisateave

Järgmise põlvkonna sekveneerimine

Tartu Ülikooli genoomika tuumiklabor pakub kvaliteetseid pika- ja lühikese järjestuse sekveneerimise teenuseid nii suunatud analüüsideks kui ka suuremahulisteks populatsioonigeneetika uuringuteks. Aitame valida teie uurimisküsimustele sobivaima sekveneerimisstrateegia ning pakume tuge kogu tööprotsessi vältel, alates proovide ettevalmistamisest ja kvaliteedikontrollist kuni andmete bioinformaatilise analüüsi ja tulemuste tõlgendamiseni.

Miks kasutada genoomika tuumiklabori sekveneerimisteenuseid?

Tipptasemel kompetents ja nüüdisaegsed tehnoloogiad
Pakume teadlastele juurdepääsu kaasaegsetele sekveneerimisplatvormidele ning nende rakendamiseks vajalikku eksperditeadmist erinevates genoomika valdkondades. Meie kogemust kinnitab osalemine ühes Euroopa suurimas pikkade järjestuste sekveneerimisel põhinevas populatsioonigenoomika projektis, mille raames sekveneeriti 10 000 Eesti Geenivaramu geenidoonori täisgenoomi.

Loe lähemalt: https://haldus.ut.ee/et/uudis/uue-sekveneerimistehnoloogia-abil-jarjest…

Terviklik tugi ühest kohast
Pakume kõiki sekveneerimisprojekti jaoks vajalikke teenuseid ühes kohas: nõustamist, proovide ettevalmistamist, sekveneerimist, andmetöötlust ja bioinformaatilist analüüsi. See tagab sujuva tööprotsessi ning kvaliteetsed tulemused.

Sekveneerimise võimalused

1. Pikkade järjestuste sekveneerimine
Pikkade järjestuste sekveneerimine sobib rakendusteks, mis nõuavad terviklikku genoomianalüüsi, struktuursete variantide täpset tuvastamist ning DNA metülatsiooni otsest analüüsi.

Kasutusvaldkonnad

  • Inimese täisgenoomi sekveneerimine

  • Struktuursete variantide analüüs

  • DNA metülatsiooni analüüs

  • Metagenoomika

  • Amplikonide sekveneerimine

  • Plasmiidide sekveneerimine

2. Lühikeste järjestuste sekveneerimine
Lühikeste järjestuste sekveneerimine pakub usaldusväärseid, suure läbilaskevõimega lahendusi paljudele laialdaselt kasutatavatele genoomikarakendustele.

Kasutusvaldkonnad

  • Eksoomi sekveneerimine

  • RNA sekveneerimine

  • Väikeste genoomide sekveneerimine

  • Metagenoomika

  • Amplikonide sekveneerimine

  • Geenipaneelide sekveneerimine

Sekveneerimisseadmed ja proovide kvaliteedikontroll

PacBio HiFi sekveneerimisel saadud pikad järjestused (1-25 kb) võimaldavad täpsemat täisgenoomi sekveneerimist, DNA metülatsiooni määramist ning keerukate genoomipiirkondade usaldusväärset analüüsi.

Kasutusvaldkonnad

  • Inimese täisgenoomi sekveneerimine
  • DNA metülatsiooni analüüs (5mC ja 6mA)
  • Metagenoomika
  • Amplikonide sekveneerimine

  • Plasmiidide sekveneerimine

PacBio_Revio3
Autor: Andres Tennus

Väga pikkade järjestuste (10-100 kb) sekveneerimine võimaldab terviklikku genoomianalüüsi ja epigeneetilist analüüsi.

Kasutusvaldkonnad

  • Täisgenoomi sekveneerimine
  • Metagenoomika
  • Amplikonide sekveneerimine
  • Plasmiidide sekveneerimine
  • RNA sekveneerimine
  • DNA metülatsiooni analüüs (5mC, 5hmC, 6mA ja 4mC)

ONT P2 Solo
Autor: Genoomika instituut

Suure läbilaskevõimega lühikeste järjestuste (50-300 bp) sekveneerimine võimaldab sekveneerida väikeseid genoome ning genoomi valitud piirkondi.

Rakendused

  • Eksoomi sekveneerimine
  • Väikeste genoomide sekveneerimine
  • RNA sekveneerimine
  • Metagenoomika
  • Amplikonite ja geenipaneelide sekveneerimine

Illumina NextSeq 2000 System

NextSeq2000
Autor: Genoomika instituut

Illumina MiSeq System

MiSeq
Autor: Genoomika instituut

Kvaliteetne sekveneerimine algab kvaliteetsest lähtematerjalist. Pakume DNA ja RNA kvaliteedi hindamist, kontsentratsiooni määramist, fragmentide pikkuse määramist ning proovide ettevalmistamist.

Kasutatavad tehnoloogiad

  • Agilent TapeStation 4200
  • Agilent Femto Pulse
  • Covaris M220
  • Yourgene Health LightBench Detect
  • Applied Biosystems real-time PCR system
  • Andmete esmane kvaliteedikontroll ja edastamine soovitud formaadis (.vcf)
  • RNA-seq ja eksoomi analüüs, inimese täisgenoomi analüüs

Hinnapakkumise ja projektiga seotud küsimuste korral võtke meiega ühendust: [email protected]