DNA sekveneerimise täisteenus
DNA sekveneerimise täisteenuse puhul saadab tellija meile oma uuritava PCR-i produkti või plasmiidi ning sekveneerimispraimerid (või valib praimeri meie poolt pakutavate universaalpraimerite hulgast). Meetodi põhimõttega saate tutvuda siin.
Sekveneerimist viime läbi Applied Biosystems 3130xl Genetic Analyzer'il ja kahel Applied Biosystems 3730xl DNA Analyzer masinal.
DNA sekveneerimise täisteenuse tellimiseks on vaja:
- Saata matriits-DNA - plasmiidi puhul 300-500 ng reaktsiooni kohta, PCR-i produkti puhul 30-50 ng reaktsiooni kohta. Igas reaktsioonisegus saame kasutada kuni 5,7 µL DNA-d
- Saata praimerid - 10 µM (ehk 10 pmol/µL) kontsentratsiooniga praimerit kulub ühe reaktsiooni peale 0,3 µL (kuid palume saata mitte vähem kui 2-3 µL)
- Täita tellimisleht, saata aadressile kapillaar [ät] ebc.ee, samuti trükkida välja ning proovidega kaasa pakkida
Pakk DNA, praimerite ning tellimislehega saata aadressile
TÜ GI tuumiklabor
Riia mnt 23b-302
51010 Tartu
Riia mnt 23b-302
51010 Tartu
Kui toote saadetise ise ära, siis ootame neid Riia maantee poolse valvuri juures olevasse külmkappi (kapp märgistatud sildiga "Sekveneerimine").
Meilt saab tellida reaktsioone järgmiste universaalpraimeritega:
Praimer | Järjestus | ap |
---|---|---|
ITS4 | TCCTCCGCTTATTGATATGC | 20 |
ITS5 | GGAAGTAAAAGTCGTAACAAGG | 22 |
M13F | GTAAAACGACGGCCAGT | 17 |
M13F-pUC(-40) | GTTTTCCCAGTCACGAC | 17 |
M13R | GCGGATAACAATTTCACACAGG | 22 |
M13R-pUC(-40) | CAGGAAACAGCTATGAC | 17 |
pJET1.2F | CGACTCACTATAGGGAGAGCGGC | 23 |
pJET1.2R | AAGAACATCGATTTTCCATGGCAG | 24 |
SP6 | ATTTAGGTGACACTATAG | 18 |
T3 | ATTAACCCTCACTAAAG | 17 |
T7 | AATACGACTCACTATAG | 17 |
T7promoter | TAATACGACTCACTATAGGG | 20 |
T7terminator | GCTAGTTATTGCTCAGCGG | 19 |
Lisateenusena pakume PCR-i produktide ensümaatilist puhastamist, mida viime läbi Thermo Scientific FastAP Thermosensitive Alkaline Phosphatase'i ja Exonuclease I-ga.
Ühtlasi on võimalik tellida kiirteenust, mille puhul garanteeritakse Teile tulemuste kättesaamine järgmise tööpäeva jooksul. Kui soovite kiirtellimuse vastuseid sama tööpäeva jooksul, siis peavad proovid olema meieni jõudnud hiljemalt kell 9.00. Kiirteenuse tellimiseks tehke sellekohane märge saatelehe lahtrisse "Märkused".
Samuti pakume keerulise matriitsi sekveneerimist, mida soovitame kasutada nukleotiidseid kordusi sisaldava, GC-rikka või sekundaarstruktuure moodustava materjali puhul. Keerulise sekveneerimise tellimiseks tehke sellekohane märge saatelehe lahtrisse "Märkused".