Genoomika instituudi teadlased juhendasid 50 bakalaureuse- ja magistritööd
Kuigi genoomika instituudil ei ole oma õppekava, teevad meie teadurid ja spetsialistid koostööd tudengitega väga erinevatelt erialadelt. Tänavu valmis nende juhendamisel 50 bakalaureuse- ja magistritööd.
Tööd käsitlesid väga erinevaid teemasid alates geneetilistest riskiteguritest ja personaalmeditsiinist kuni mikrobioomi, rahvastikugeneetika, tehisintellekti ning käitumisteadusteni.
Teemade lai valik annab aimdust valdkonna arengust ja peegeldab genoomika kasvavat mõju nii tervishoius kui ka ühiskonna toimimise mõtestamisel. Lõputöödes uuriti näiteks südame-veresoonkonna haiguste riskiennustust, söömiskäitumise ja isiksuse seoseid, Eesti mineviku ja tänapäeva populatsioonide geneetilist mitmekesisust ning tehisintellekti rakendamist terviseandmete analüüsis.
|
|
|---|
|
|
|---|
| Enim töid juhendanud teadlased |
|---|
| Uku Vainik (13 tööd) Krista Fischer (7 tööd) Jaanika Kronberg (4 tööd) Triin Laisk (3 tööd) Anastassia Kolde (3 tööd) Kristiina Tambets (3 tööd) |
| Teadlased, kes juhendasid kaht tööd |
|---|
| Erik Abner Jéssica Figuerêdo Campos de Jesus Kateryna Pantiukh Katri Pärna Kertu Liis Krigul Mart Kals Merli Koitmäe Michael Dannemann |
| Teadlased, kes juhendasid üht tööd | |
|---|---|
| Aigar Ottas Ajai K Pathak Alena Kushniarevich Biancamaria Bonucci Birgit Malken Danat Yermakovich Erkin Alaçamlı Jelisaveta Džigurski Kanwal Batool Kelli Lehto Kerli Ilves Kreete Lüll Lehti Saag Liis Leitsalu Maarja Jõeloo | Mari Nelis Mari Sepp Mariann Võsa Maris Alver Merve Nur Güler Monika Karmin Nele Taba Oliver Aasmets Roberto Didonna Toomas Haller Triinu Ojalo Tuuli Puusepp Tõnis Org |
Bakalaureusetööd
| Autor | Pealkiri | Juhendaja |
|---|---|---|
| Liseth Dietrich | Rindade hüpertroofiaga seotud geneetiliste variantide tuvastamine ja kandidaatgeenide prioritiseerimine/ Identification of genetic variants and prioritization of genes associated with breast hypertrophy | Mariann Võsa; Jéssica Figuerêdo Campos de Jesus |
| Simone Heinsaar | Munasarjade, munajuhade ja laiade emakasidemete arenguanomaaliate geneetilised tegurid/ Genetic Determinants of Developmental Anomalies of Ovaries, Fallopian Tubes and Broad Ligaments | Triin Laisk; Jéssica Figuerêdo Campos de Jesus |
| Mia Golob | Genetic risk factors of vasomotor menopausal symptoms | Triin Laisk, Jelisaveta Džigurski |
| Birthe Läll | Psühhootilise häirega patsientidele mõeldud metaboolse sündroomi riski prognoosimudeli valideerimine Eesti geenivaramu andmetel / Validation of a Metabolic Syndrome Risk Predicition Model for Patients with Psychotic Disorders using the Estonian Biobank Data | Maris Alver; Märt Möls |
| Lisette Haug | Emakamüoomide geneetilised riskifaktorid ja võimalike ravimsihtmärkide leidmine TÜ Eesti Geenivaramu ja Soome FinnGen andmetel | Triin Laisk |
| Marleen Roomet | Söömishäirete tunnuste geneetika uurimine SCOFF küsimustiku põhjal Eesti Biopangas/Investigating genetics of eating disorde symptoms based on the SCOFF questionnaire at the Estonian Biopank | Katri Pärna |
| Hannabeth Hansen | Aktiivsus- ja tähelepanuhäire geneetilise eelsoodumuse seosed diagnooside kasvu ja sotsiaal-demograafiliste tunnustega/ Associations of genetic predisposition to attention-deficit/hyperactivity disorder with the growth in diagnoses and socio-demographic characteristics | Katri Pärna, Kelli Lehto, Anastassia Kolde |
| Markus Salum | Eesti rauaaja inimeste bioloogilise suguluse uurimine alleelisageduste ja ühistelt eelkäijatelt päritud identsete genoomilõikude analüüsi abil / Allele frequency-based and IBD segment analysis to reveal the biological relatedness of Iron Age individuals of Estonia | Lehti Saag, Roberto Didonna, Kristiina Tambets |
| Gea Roost | Isiksuseomaduste ja toitumisharjumuste seosed Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu andmete põhjal / Associations Between Personality Traits and Dietary Habits Based on Data from the Estonian Biobank at the University of Tartu | Uku Vainik; Darina-Eisal Kononova |
| Kristin Haase | Toidu neofoobia seosed Suure Viisiku domeenide ja isiksusenüanssidega 100 NP küsimustiku alusel Eesti Geenivaramu andmetel / Associations Between Food Neophobia and Big Five Domains and Personality Nuances Based on the 100NP Questionnaire Using Estonian Biobank Data | Uku Vainik; Karolina Anja |
| Agneta Vahtra | Isiksuse mõju valimistel osalemisele: Suure Viisiku ja üksikväidete analüüs Eesti Geenivaramu andmestiku põhjal / The Role of Personality in Voter Turnout: Analysis of the Big Five and Individual Items based on Estonian Biobank data | Uku Vainik; Piret Ehin |
| Janeli Alliksaar | Polügeensete skooride ja isiksuseomaduste seosed eneseraporteeritud kehalise aktiivsusega / Associations Between Polygenic Scores, Personality Traits, and Self-Reported Physical Activity | Uku Vainik; Kerli Ilves |
| Karolin Holz | Kronotüübi ja isiksuseomaduste seosed / Connections between chronotype and personality traits | Uku Vainik; Liisi Ausmees |
| Lotta Kivistik | Isiksuseomaduste geneetiline eelsoodumus ja neurootilisus: paarisuhte mõju Eesti Geenivaramu andmetel / Genetic Predisposition to Personality Traits and Neuroticism: the Effect of Marital Status based on the Data from the Estonian Biobank | Uku Vainik; Liisi Ausmees |
| Triin Tillemann | Nartsissismi polügeense eelsoodumuse ja isiksuseomaduste seosed Eesti Geenivaramu andmetel / Associations Between the Polygenic Index for Narcissism and Personality Traits Based on Estonian Biobank Data | Uku Vainik; Helo Liis Ojalo |
| Triinu Tammaru | Nelja psühhiaatria faktori seosed Suure Viisiku domeenide ja üksikväidetega Eesti geenivaramu andmetel / Associations Between Four Psychiatric Factors and Big Five Personality Doimains and Individual Items Based on Estonian Biobank Data | Uku Vainik; Helo Liis Ojalo |
| Markus Uibo | Suure viisiku seosed kehakompositsiooni näitajatega Eesti geenivaramu valimis / Associations Between Big Five Personality Traits and Body Composition Indicators in the Estonian Biobank Sample | Uku Vainik; Kadri Arumäe |
| Annabel Palu | Toidueelistuste seos Suure Viisiku isiksuseomadustega / Associations between dietary preferences and the Big Five personality traits | Uku Vainik; Birgit Malken |
| Mouna Belkouraichi | Genetic and molecular factors affecting vitamin B12 levels in Estonian Biobank | Erik Abner; Kanwal Batool |
| Tobias Remmelg | Sugulusmustrid kaasaegsetes Euraasia ja keskaegses Eesti populatsioonis homosügootsete genoomipiirkondade pikkusanalüüsi põhjal / Patterns of parental relatedness in present‑day Eurasians and Medieval Estonian population inferred from runs of homozygosity | Alena Kushniarevich; Erkin Alaçamlı; Kristiina Tambets |
| Sofiia Stefaniia Polishchuk | Investigating the genetic and ancestral diversity of an immune response locus / Immuunvastuse lookuse geneetilise ja esivanemate mitmekesisuse uurimine | Michael Dannemann |
| Rait Robert Suurmets | Suhtelise riski ja šansside suhte hindamine binaarse tulemiga regressioonmudelites. Rakendus Eesti Geenivaramu andmete näitel | Anastassia Kolde, Triinu Ojalo |
| Kateryna Chaharna | Gen2PhenSim: a configurable genotype to phenotype simulator / Gen2PhenSim: genotüübipõhine konfigureeritav fenotüübisimulaator | Merve Nur Güler |
| Vanessa Viiding | Arhede tuvastamist mõjutavad tegurid inimese soolestiku mikrobioomi uuringutes | Kertu Liis Krigul, Kateryna Pantiukh |
| Oleksandr Kholonivskyi | Characterizing the genomic diversity of prevalent gut microbiome bacterial species using metagenome-assembled genomes | Kateryna Pantiukh, Kertu Liis Krigul |
| Hanna Kangur | Kodade virvendusarütmia ja laperduse riski prognoosimine TÜ Eesti Geenivaramu näitel | Krista Fischer, Tuuli Puusepp |
| Lisett Klement | TÜ Eesti geenivaramu geenidoonorite tervisega seotud elukvaliteet | Krista Fischer, Taavi Lai |
| Heilika Nigulas | Valikunihe ja selle korrigeerimise meetodid TÜ Eesti geenivaramu näitel | Krista Fischer |
| Kaur-Erik Suurorg | Eksposoomi mõju insuldi tekkele | Jaanika Kronberg, Krista Fischer |
| Adelina Toom | Õhureostuse põhjuslik mõju astmariskile | Krista Fischer, Jaanika Kronberg |
| Rasmus Vabrit | MinuGeenivaramu portaali külastajate tagasiside analüüs | Krista Fischer, Liis Leitsalu |
| Beatrice Carraro | Exploratory Population Genetic Analysis of Indian Populations Using PCA and F-statistics | Ajai K Pathak (UT), Luca Pagani and Marco Mongillo (University of Padova) |
| Emma Vahelaan | Matemaatilise kirjaoskuse ja loovmõtlemise seosed PISA testi 2022. aasta Eesti andmetel | Anne-Mai Kaljuste, Mart Kals |
| Merit Matt | Koronaararterite kaltsiumiskoori ja kardiovaskulaarse riski diskordantsus ja selle seosed polügeense riskiga Eesti geenivaramu andmetel | Mart Kals, Kaido Paapstel |
| Sandor-Hannes Soosaar | Metagenomic analysis of medieval and early modern period dental calculus samples from Estonia | Biancamaria Bonucci, Kristiina Tambets |
| Karolina Nõu | Polütsüstiliste munasarjade sündroomi ja soolestiku mikrobioomi vahelised seosed The Role of the Gut Microbiome in Polycystic Ovary Syndrome | Kreete Lüll |
| Magda Grete Kibuspuu | GOT1 geeni pealt kodeeritava ASAT valgu Gln208Glu mutatsiooni funktsionaalne mõju makro-ASAT kompleksi tekkele The effect of the mutation Gln208Glu in protein AST | Tõnis Org, Erik Abner |
| Railin Viik | Raseduskatkemiste geneetiliste põhjuste tuvastamine DNA mikrokiibiga / Identifying genetic causes of miscarriages with DNA microarray | Ants Kurg, Mari Nelis |
| Mariya Roy | Expression Patterns of Ataxia-Associated Genes During Human Cerebellum Development | Mari Sepp |
| Eduard Kuus | Vankomütsiini AUC24 sihtvahemiku saavutamine ja seda mõjutavad tegurid (pole avalikuks kasutamiseks kuni 01.05.2029). | Merli Koitmäe, Hanna Kadri Laas |
| Laura Mia Mikk | Ägeda neerukahjustuse esinemise võrdlus baaskontsentratsioonidel põhineva ja mudelipõhise vankomütsiini doseerimise korral. | Merli Koitmäe, Hanna Kadri Laas |
| Kaur Tenson | Inimese genoomis esinevate struktuursete variantide sageduse modelleerimine. | Maarja Jõeloo, Märt Möls |
| Natalja Korabljova | Tõkestatud keskmise eluea meetod elukestusandmete analüüsis. | Anastassia Kolde |
Magistritööd
| Autor | Pealkiri | Juhendaja |
|---|---|---|
| Melian Heinsaar | Ligikaudu pool kehamassiindeksi varieeruvusest on selgitatav isiksuseomadustega: isiksuse, söömiskäitumise ja kehamassiindeksi mitme meetodi uuring / Nearly Half of BMI Variance Is Explained by Personality Traits: A Multi-Method Study of Personality, Eating Behaviour, and Body Mass Index | Uku Vainik; Rene Mõttus |
| Senta Karus | Katusülevaade: kaalu langetamist ja säilitamist mõjutavad tegurid ning nende kattuvus ADOPT ja OxFAB taksonoomiatega / Factors associated with weight loss and weight loss maintenance: an umbrella review and comparison with the ADOPT and OxFAB taxonomies | Uku Vainik; Kari Kuulman |
| Andres Maask | Isiksuse seos sissetulekuga: nüansside ennustusvõime ja isiku-ametikoha sobivuse roll / The Association Between Personality and Income: Predictive Power of Nuances and the Role of Person-Occupation Fit | René Mõttus, Uku Vainik |
| Kirill Nitsenko | Disentangling the archaic ancestry in Papuan populations | Michael Dannemann; Monika Karmin; Danat Yermakovich |
| Lotta-Lorette Kalmaru | Early CKD Prediction from Exposomic Data via Machine Learning and Deep Unfolding | Toomas Haller, Aigar Ottas, Jaanika Kronberg |
| Emma Räim | Linnakeskkonna mõjutegurite ja metaboliitide seosed kõrgvererõhktõvega Eesti Geenivaramu andmete põhjal; Joint associations of urban exposures and metabolites with hypertension in the Estonian Biobank | Jaanika Kronberg, Mara Delesa-Velina, Ruben Colindres, Krista Fischer |
| Mirel Mesila | Defining a microbiome-based gut health index based on similarity to non-westernized populations | Nele Taba, Oliver Aasmets |
Loe veel sarnaseid uudiseid
