Genoomika instituudis kaitstud tööd
Järgnevalt saab tutvuda genoomika instituudi teadlaste juhendamisel kaitstud doktoritöödega.
Tööd on kaitstud alates 2018. aastast genoomika instituudis ning varasematel aastatel Eesti Biokeskuses ja TÜ Eesti geenivaramus.
- Maarja Jõeloo „Arengud mikrokiibipõhiste koopiaarvu variatsioonide tuvastamises ja fenotüüpidega seostamises“, 31. mai 2024
Juhendajad: professor Reedik Mägi, Tartu Ülikool, professor Andres Metspalu, Tartu Ülikool, professor Andres Salumets, Tartu Ülikool, professor Andrew P. Morris, Manchesteri Ülikool (Suurbritannia)
- Mathilde André „New Guinea, a hotspot for Human evolution: settlement history and adaptation in northern Sahul“, 12. september 2023
Juhendajad: Mayukh Mondal, Tartu Ülikool, Kieli Ülikool; François-Xavier Ricaut, Toulouse'i Ülikool
- Nele Taba „Diet, blood metabolites, and health“, Tartu, 9. september 2022
Juhendajad: professor Krista Fischer, Tartu Ülikool, professor Tõnu Esko, Tartu Ülikool, Nicola Pirastu, Edinburghi Ülikool (Ühendkuningriik), professor Andres Metspalu, Tartu Ülikool
- Katri Pärna „Improving the personalized prediction of complex traits and diseases: application to type 2 diabetes“, Groningen, 7. september 2022
Juhendajad: professor Luca Pagani, Tartu Ülikool ja Padova Ülikool (Itaalia), teadur Davide Marnetto, Torino Ülikool (Itaalia), professor Harold Snieder, Groningeni Ülikool (Holland), vanemteadur Ilja M. Nolte, Groningeni Ülikool (Holland), professor Krista Fischer, Tartu Ülikool, professor Reedik Mägi, Tartu Ülikool
- Tina Saupe „The genetic history of the Mediterranean before the common era: a focus on the Italian Peninsula“, Tartu, 26. august 2022
Juhendajad: kaasprofessor Christiana Lyn Scheib, Tartu Ülikool, professor Mait Metspalu, Tartu Ülikool, kaasprofessor Toomas Kivisild, Tartu Ülikool, külalisprofessor Luca Pagani, Tartu Ülikool
- Ludovica Molinaro „Ancestry deconvolution of Estonian, European and Worldwide genomic layers: a human population genomics excavation", 20. juuni 2022
Juhendajad: Luca Pagani, Tartu Ülikool, Francesco Montinaro, Tartu Ülikool, Mait Metspalu, Tartu Ülikool
- Kreete Lüll „Investigating the relationships between human microbiome, host factors and female health", Tartu, 13. mai 2022
Juhendaja: kaasprofessor Elin Org, Tartu Ülikool
- Ajai Kumar Pathak „Induse jõe oru inimeste, parside, India juutide ja Tharu hõimu geneetilise põlvnemise piiritlemine", Tartu, 15. juuni 2021
Juhendajad: prof Richard Villems (TÜ genoomika instituut / TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja prof Gyaneshwer Chaubey (Banaras Hindu ülikool)
- Burak Yelmen „Iidsete Euraasia mõjude iseloomustamine tänapäeva inimgenoomides", Tartu, 24. august 2021
Juhendajad: külalisprof Luca Pagani (TÜ genoomika instituut), prof Mait Metspalu (TÜ genoomika instituut) ja kaasprof Toomas Kivisild (TÜ genoomika instituut)
- Linda Ongaro „Ameerika populatsioonide genoomne portreest", Tartu, 31. august 2021
Juhendajad: teadur Francesco Montinaro (TÜ genoomika instituut), külalisprof Luca Pagani (TÜ genoomika instituut), prof Mait Metspalu (TÜ genoomika instituut)
- Viktorija Kukuškina „Geeniekspressiooni andmete integreerimine teiste 'oomika' andmetega kirjeldamaks endomeetriumi retseptiivsuse mehhanisme“, Tartu, 29. juuni 2020
Juhendajad: juhtivteadur Reedik Mägi (TÜ genoomika instituut), juhtivteadur, prof Andres Metspalu (TÜ genoomika instituut, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut), juhtivteadur, prof Andres Salumets (TÜ genoomika instituut, TÜ kliinilise meditsiini instituut)
- Helen Post ,,Ülevaade Põhja_Euraasias laialt levinud Y_kromosoomaalse haplogrupi N fülogeneesist ja fülogeograafiast ning Euroopa kahe keeleliselt erandliku rahva - ungarlaste ja kalmõkkide - populatsiooniuuringud", Tartu, 26. august 2020
Juhendajad: vanemteadur Siiri Rootsi (TÜ genoomika instituut) ja juhtivteadur, prof Richard Villems (TÜ genoomika instituut, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Kristi Krebs ,,Farmakoteraapias esinevate kõrvaltoimete geneetika uurimine biopankade ja elektrooniliste terviseandmete põhjal", Tartu, 27. august 2020
Juhendajad: juhtivteadur Lili Milani (TÜ genoomika instituut) ja juhtivteadur, prof Andres Metspalu (TÜ genoomika instituut, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Maris Alver "Geeniinfo väärtus kardiovaskulaarhaiguste riski hindajana", Tartu, 04. juuni 2019
Juhendajad: juhtivteadur, prof Andres Metspalu (TÜ genoomika instituut, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja vanemteadur Tõnu Esko (TÜ genoomika instituut) - Lehti Saag “Eesti esiajalugu geneetika vaatevinklist: uus teave vana DNA uuringutest”, Tartu, 12. september 2019
Juhendajad: vanemteadur Mait Metspalu (TÜ genoomika instituut), vanemteadur Kristiina Tambets (TÜ genoomika instituut) ja vanemteadur, prof Toomas Kivisild (TÜ genoomika instituut, Leuven KU) - Erwan Pennarun „Uidates mtDNA fülogeneesi radadel; essee väikeste kõrvalepõigetega sellest, mida see meile inimese migratsioonidest kõnelda võib”, Tartu, 07. oktoober 2019
Juhendajad: juhtivteadur, prof Richard Villems (TÜ genoomika instituut, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja vanemteadur Mait Metspalu (TÜ genoomika instituut) Anne-Mai Ilumäe „Uurali rahvaste geneetiline ajalugu läbi isaliini N ja autosoomse varieeruvuse prisma", Tartu, 12. november 2019
Juhendajad: vanemteadur Kristiina Tambets (TÜ genoomika instituut), vanemteadur Siiri Rootsi (TÜ genoomika instituut) ja juhtivteadur, prof Richard Villems (TÜ genoomika instituut, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Natalia Pervjakova “Geneetilise vermimise mõju komplekstunnustele”, Tartu, 22. juuni 2018
Juhendajad: vanemteadur Reedik Mägi (TÜ genoomika instituut) ja direktor, prof Andres Metspalu (TÜ genoomika instituut, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Monika Karmin “Vaade inimese Y kromosoomile – fülogenees, populatsiooni dünaamika ja asutajasündmused”, Tartu, 10. detsember 2018
Juhendajad: vanemteadur Mait Metspalu (TÜ genoomika instituut), vanemteadur Ene Metspalu (TÜ genoomika instituut), vanemteadur Siiri Rootsi (TÜ genoomika instituut), vanemteadur Toomas Kivisild (TÜ genoomika instituut)
- Kaie Lokk “Inimese tervete kudede ja mitteväikerakulise kopsuvähi võrdlevad ülegenoomsed DNA metülatsiooni uuringud”, Tartu, 20. jaanuar 2017
Juhendajad: vanemteadur Neeme Tõnisson (TÜ Eesti geenivaramu) ja vanemteadur Lili Milani (TÜ Eesti geenivaramu)
- Riin Tamm “Uute tiopuriinmetüültransferaasi aktiivsust mõjutavate biomarkerite otsingul”, Tartu, 09. juuni 2017
Juhendajad: direktor, prof Andres Metspalu (TÜ Eesti geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja vanemteadur Lili Milani (TÜ Eesti geenivaramu)
- Silva Kasela „Geeniekspressiooni geneetiline regulatsioon: koe- ja rakutüübi-spetsiifiliste efektide leidmine”, Tartu, 22. august 2017
Juhendajad: vanemteadur Lili Milani (TÜ Eesti geenivaramu), vanemteadur Krista Fischer (TÜ Eesti geenivaramu) ja direktor, prof Andres Metspalu (TÜ Eesti geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Liis Leitsalu “Genoomsete teadustöötulemuste tagasiside populatsioonipõhise biopanga geenidoonoritele”, Tartu, 05. detsember 2016
Juhendajad: direktor, prof Andres Metspalu (TÜ Eesti geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja dr Pauline Ng (Singapuri Genoomi Instituudi töörühma juht)
- Urmo Võsa “MikroRNAde roll haiguste kujunemisel: aberratsioonid kopsuvähis ning seosed genoomse varieeruvusega”, Tartu, 23. august 2016
Juhendaja: vanemteadur Tarmo Annilo (TÜ Eesti geenivaramu)
- Tiit Örd “Imetajate pseudokinaasi TRIB3 funktsioonid ja regulatsioon”, Tartu, 23 mai 2016
Juhendajad: prof Jaanus Remme (TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja vanemteadur Tõnis Örd (Eesti Biokeskus)
- Chandana Basu Mallick “Adaptatiivsete tunnuste geneetika ja soo-spetsiifilised demograafilised protsessid Lõuna-Aasia populatsioonides”, Tartu, 16 jaanuar 2015
Juhendajad: juhtivteadur, professor Richard Villems (Eesti Biokeskus, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja vanemteadur, külalisprof, lektor Toomas Kivisild (Eesti Biokeskus, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Cambridge’i Ülikool)
- Eneli Oitmaa „Praimerekstensiooni meetodil põhinevate DNA kiipide kasutamine molekulaardiagnostikas", Tartu, 13. jaanuar 2014
Juhendaja: direktor, prof Andres Metspalu (TÜ Eesti geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Georgi Hudjašov „Mitokondriaalse DNA, Y kromosoomi ja türosinaasi varieeruvus Euraasia ja Okeaania populatsioonides”, Tartu, 07. november 2013
Juhendajad: vanemteadur, külalisprof, õppejõud Toomas Kivisild (Eesti Biokeskus, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Cambridge'i Ülikool) direktor, prof Richard Villems (Eesti Biokeskus, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Mari Järve „Erinevad geneetilised perspektiivid inimajaloole Euroopas ja Kaukaasias: lood, mida räägivad haploidsed ja autosomaalsed markerid“, Tartu, 11. juuni 2012
Juhendajad: direktor, prof Richard Villems (Eesti Biokeskus, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja vanemteadur Siiri Rootsi (Eesti Biokeskus)
- Tõnu Esko “Genotüpiseerimiskiibi andmete uudsed rakendused Euroopa geneetilise struktuuri analüüsil ning geneetilistes assotsiatsioonuuringutes”, Tartu, 19. oktoober 2012
Juhendaja: direktor, prof Andres Metspalu (TÜ Eesti geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Siim Sõber „Vererõhu geneetika: kandidaatgeenidest ülegenoomsete assotsiatsiooniuuringuteni“, Tartu, 04. mai 2011
Juhendajad: prof Maris Laan (TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja vanemteadur Tarmo Annilo (TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Tiit Nikopensius ”Mittesündroomsete suulõhede geneetiline eelsoodumus”, Tartu, 22. august 2011
Juhendaja: direktor, prof Andres Metspalu (TÜ Eesti geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Kristjan Välk “Mitteväikerakulise kopsuvähi kogu genoomi geeniekspressiooni- ja assotsiatsiooniuuringud”, Tartu, 25. august 2011
Juhendaja: direktor, prof Andres Metspalu (TÜ Eesti geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Signe Altmäe „Stimuleeritud ovariaalne follikulogenees: geneetiliste faktorite uuring“, Tartu, 29. jaanuar 2010
Juhendajad: direktor, prof Andres Metspalu (TÜ Eesti geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja vanemteadur Andres Salumets (TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Mari Nelis „Eesti populatsiooni geneetiline struktuur ja geneetiline kaugus teistest Euroopa päritolu populatsioonidest“, Tartu, 09. aprill 2010
Juhendaja: direktor, prof Andres Metspalu (TÜ Eesti geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Kaarel Krjutškov „Geenikiibil põhinev genotüpiseerimise meetod, APEX-2, kui paindlik lahendus DNA variatsioonide määramiseks“, Tartu, 04. mai 2010
Juhendaja: direktor, prof Andres Metspalu (TÜ Eesti geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Toomas Silla „Veise papilloomiviiruse tüüp 1 segregatsioonimehhanismi uurimine“, Tartu, 17. september
Juhendajad: prof Mart Ustav (TÜ tehnoloogiainstituu) ja erakorraline vanemteadur Aare Abroi (Eesti Biokeskus)
- Gyaneshwer Chaubey „India demograafiline ajalugu: pilt läbi geneetilise andmestiku“, Tartu, 20. september 2010
Juhendajad: vanemteadur Toomas Kivisild (Eesti Biokeskus) ja vanemteadur Ene Metspalu (TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Maarja Adojaan „HI-viiruse molekulaarne varieeruvus ja selle teadmise kasutamine vaktsiini väljatöötamisel“, Tartu, 17. detsember 2009
Juhendajad: direktor, erakorraline prof Richard Villems (Eesti Biokeskus, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja prof Mart Ustav (TÜ tehnoloogiainstituut)
- Janne Pullat "In situ sünteesitud oligonukleotiidide mikrokiibi disain, funktsionaliseerimine ja rakendamine", Tartu, 21. november 2008
Juhendaja: direktor, prof Andres Metspalu (TÜ Eesti geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Daima Örd "Uurimus stressi poolt indutseeritavast pseudokinaasist TRB3, transkriptsioonifaktori ATF4 uuest inhibiitorist", Tartu, 25. august 2008
Juhendaja: vanemteadur Tõnis Örd (Eesti Biokeskus) ja prof Jaanus Remme (TÜ molekulaar- ja rakubioloogia Instituut)
- Elin Lõhmussaar ”Alleelse aheldatuse (LD) struktuuri uurimine Euroopa opulatsioonides ja selle rakendused geneetilistes assotsiatsiooniuuringutes”, Tartu, 19. jaanuar 2006
Juhendaja: juhatuse liige, prof Andres Metspalu (Eesti Geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Mait Metspalu ”India eelajaloo käsitlus mtDNA vaatevinklis”, Tartu, 19. detsember 2005
Juhendaja: direktor, erakorraline prof Richard Villems (Eesti Biokeskus, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja erakorraline vanemteadur, prof Toomas Kivisild (Eesti Biokeskus, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Krista Kaasik ”Ööpäeva rütme tekitavate geenide roll imetajate bioloogilises kellas, ainevahetuses ja käitumises”, Tartu, 29. juuni 2005
Juhendajad: juhatuse liige, prof Andres Metspalu (Eesti Geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja Cheng Chi Lee, PhD (University of Texas Health Science Center-Houston)
- Kati Koido „22 kandidaatgeeni ühenukleotiidsete polümorfismide profiilide seos meeleolu- ja ärevushäiretega”, Tartu, 2005
Juhendajad: juhatuse liige,, prof Andres Metspalu (Eesti Geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja vanemteadur Sulev Kõks (TÜ arstiteaduskond)
- Siiri Rootsi „Inimese Y-kromosomaalne varieeruvus Euroopa populatsioonides“, Tartu, 09. detsember 2004
Juhendaja: direktor, prof Richard Villems (Eesti Biokeskus, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Kristiina Tambets ”Inimese mitokondriaalse DNA haplogruppide jääajajärgsest levikust Euroopas ja kaugemal: fülogeograafiline analüüs”, Tartu, 18. juuni 2004
Juhendaja: direktor, prof Richard Villems (Eesti Biokeskus, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Tiina Kahre ”Tsüstiline fibroos Eestis”, Tartu, 14. mai 2004
Juhendaja: juhatuse liige, prof Andres Metspalu (Eesti Geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Neeme Tõnisson „Mutation detection by primer extension on oligonucleotide microarrays“, Tartu, 10. jaanuar 2003
Juhendaja: prof Andres Metspalu (TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Ade Kallas „VIII koagulatsioonifaktori vastaste antikehade iseloomustamine“, Tartu, 2002
Juhendajad: prof Hele Everaus (TÜ hematoloogia-onkoloogia kliinik) ja vanemteadur Margus Pooga (Eesti Biokeskus)
- Toomas Kivisild „Mitokondriaalse DNA varieerumine Lõuna- ja Lääne-Euraasia rahvastel ning nende päritolu“, Tartu, 09. mai 2000
Juhendaja: direktor, prof Richard Villems (Eesti Biokeskus, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Tarmo Annilo „Imetajate ribosoomivalk S7: homoloogsete geenide isoleerimine ning valgu lokalisatsioon rakus“, Tartu, 15. jaanuar 1999
Juhendaja: prof Andres Metspalu (TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Ana Rebane „Studies on Mammalian Ribosomal Protein S3a Genes and Intron-encoded Small Nucleolar RNAs U73 and U82“, Tartu, 24. november 1999
Juhendaja: prof Andres Metspalu (TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Jaanus Remme „Studies on the peptidyltransferase centre of the E.coli ribisome“, Tartu, 25. veebruar 1993
Juhendaja: direktor,, prof Richard Villems (Eesti Biokeskus, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
