Genoomika instituudis kaitstud tööd
Järgnevalt saab tutvuda genoomika instituudi teadlaste juhendamisel kaitstud doktoritöödega.
Tööd on kaitstud alates 2018. aastast genoomika instituudis ning varasematel aastatel Eesti Biokeskuses ja TÜ Eesti geenivaramus.
- Ajai Kumar Pathak „Induse jõe oru inimeste, parside, India juutide ja Tharu hõimu geneetilise põlvnemise piiritlemine", Tartu, 15. juuni 2021
Juhendajad: prof Richard Villems (TÜ genoomika instituut / TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja prof Gyaneshwer Chaubey (Banaras Hindu ülikool)
- Burak Yelmen „Iidsete Euraasia mõjude iseloomustamine tänapäeva inimgenoomides", Tartu, 24. august 2021
Juhendajad: külalisprof Luca Pagani (TÜ genoomika instituut), prof Mait Metspalu (TÜ genoomika instituut) ja kaasprof Toomas Kivisild (TÜ genoomika instituut)
- Linda Ongaro „Ameerika populatsioonide genoomne portreest", Tartu, 31. august 2021
Juhendajad: teadur Francesco Montinaro (TÜ genoomika instituut), külalisprof Luca Pagani (TÜ genoomika instituut), prof Mait Metspalu (TÜ genoomika instituut)
- Viktorija Kukuškina „Geeniekspressiooni andmete integreerimine teiste 'oomika' andmetega kirjeldamaks endomeetriumi retseptiivsuse mehhanisme“, Tartu, 29. juuni 2020
Juhendajad: juhtivteadur Reedik Mägi (TÜ genoomika instituut), juhtivteadur, prof Andres Metspalu (TÜ genoomika instituut, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut), juhtivteadur, prof Andres Salumets (TÜ genoomika instituut, TÜ kliinilise meditsiini instituut)
- Helen Post ,,Ülevaade Põhja_Euraasias laialt levinud Y_kromosoomaalse haplogrupi N fülogeneesist ja fülogeograafiast ning Euroopa kahe keeleliselt erandliku rahva - ungarlaste ja kalmõkkide - populatsiooniuuringud", Tartu, 26. august 2020
Juhendajad: vanemteadur Siiri Rootsi (TÜ genoomika instituut) ja juhtivteadur, prof Richard Villems (TÜ genoomika instituut, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Kristi Krebs ,,Farmakoteraapias esinevate kõrvaltoimete geneetika uurimine biopankade ja elektrooniliste terviseandmete põhjal", Tartu, 27. august 2020
Juhendajad: juhtivteadur Lili Milani (TÜ genoomika instituut) ja juhtivteadur, prof Andres Metspalu (TÜ genoomika instituut, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
-
Maris Alver "Geeniinfo väärtus kardiovaskulaarhaiguste riski hindajana", Tartu, 04. juuni 2019
Juhendajad: juhtivteadur, prof Andres Metspalu (TÜ genoomika instituut, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja vanemteadur Tõnu Esko (TÜ genoomika instituut) -
Lehti Saag “Eesti esiajalugu geneetika vaatevinklist: uus teave vana DNA uuringutest”, Tartu, 12. september 2019
Juhendajad: vanemteadur Mait Metspalu (TÜ genoomika instituut), vanemteadur Kristiina Tambets (TÜ genoomika instituut) ja vanemteadur, prof Toomas Kivisild (TÜ genoomika instituut, Leuven KU) -
Erwan Pennarun „Uidates mtDNA fülogeneesi radadel; essee väikeste kõrvalepõigetega sellest, mida see meile inimese migratsioonidest kõnelda võib”, Tartu, 07. oktoober 2019
Juhendajad: juhtivteadur, prof Richard Villems (TÜ genoomika instituut, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja vanemteadur Mait Metspalu (TÜ genoomika instituut) -
Anne-Mai Ilumäe „Uurali rahvaste geneetiline ajalugu läbi isaliini N ja autosoomse varieeruvuse prisma", Tartu, 12. november 2019
Juhendajad: vanemteadur Kristiina Tambets (TÜ genoomika instituut), vanemteadur Siiri Rootsi (TÜ genoomika instituut) ja juhtivteadur, prof Richard Villems (TÜ genoomika instituut, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Natalia Pervjakova “Geneetilise vermimise mõju komplekstunnustele”, Tartu, 22. juuni 2018
Juhendajad: vanemteadur Reedik Mägi (TÜ genoomika instituut) ja direktor, prof Andres Metspalu (TÜ genoomika instituut, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Monika Karmin “Vaade inimese Y kromosoomile – fülogenees, populatsiooni dünaamika ja asutajasündmused”, Tartu, 10. detsember 2018
Juhendajad: vanemteadur Mait Metspalu (TÜ genoomika instituut), vanemteadur Ene Metspalu (TÜ genoomika instituut), vanemteadur Siiri Rootsi (TÜ genoomika instituut), vanemteadur Toomas Kivisild (TÜ genoomika instituut)
- Kaie Lokk “Inimese tervete kudede ja mitteväikerakulise kopsuvähi võrdlevad ülegenoomsed DNA metülatsiooni uuringud”, Tartu, 20. jaanuar 2017
Juhendajad: vanemteadur Neeme Tõnisson (TÜ Eesti geenivaramu) ja vanemteadur Lili Milani (TÜ Eesti geenivaramu)
- Riin Tamm “Uute tiopuriinmetüültransferaasi aktiivsust mõjutavate biomarkerite otsingul”, Tartu, 09. juuni 2017
Juhendajad: direktor, prof Andres Metspalu (TÜ Eesti geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja vanemteadur Lili Milani (TÜ Eesti geenivaramu)
- Silva Kasela „Geeniekspressiooni geneetiline regulatsioon: koe- ja rakutüübi-spetsiifiliste efektide leidmine”, Tartu, 22. august 2017
Juhendajad: vanemteadur Lili Milani (TÜ Eesti geenivaramu), vanemteadur Krista Fischer (TÜ Eesti geenivaramu) ja direktor, prof Andres Metspalu (TÜ Eesti geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Liis Leitsalu “Genoomsete teadustöötulemuste tagasiside populatsioonipõhise biopanga geenidoonoritele”, Tartu, 05. detsember 2016
Juhendajad: direktor, prof Andres Metspalu (TÜ Eesti geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja dr Pauline Ng (Singapuri Genoomi Instituudi töörühma juht)
- Urmo Võsa “MikroRNAde roll haiguste kujunemisel: aberratsioonid kopsuvähis ning seosed genoomse varieeruvusega”, Tartu, 23. august 2016
Juhendaja: vanemteadur Tarmo Annilo (TÜ Eesti geenivaramu)
- Tiit Örd “Imetajate pseudokinaasi TRIB3 funktsioonid ja regulatsioon”, Tartu, 23 mai 2016
Juhendajad: prof Jaanus Remme (TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja vanemteadur Tõnis Örd (Eesti Biokeskus)
- Chandana Basu Mallick “Adaptatiivsete tunnuste geneetika ja soo-spetsiifilised demograafilised protsessid Lõuna-Aasia populatsioonides”, Tartu, 16 jaanuar 2015
Juhendajad: juhtivteadur, professor Richard Villems (Eesti Biokeskus, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja vanemteadur, külalisprof, lektor Toomas Kivisild (Eesti Biokeskus, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Cambridge’i Ülikool)
- Eneli Oitmaa „Praimerekstensiooni meetodil põhinevate DNA kiipide kasutamine molekulaardiagnostikas", Tartu, 13. jaanuar 2014
Juhendaja: direktor, prof Andres Metspalu (TÜ Eesti geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Georgi Hudjašov „Mitokondriaalse DNA, Y kromosoomi ja türosinaasi varieeruvus Euraasia ja Okeaania populatsioonides”, Tartu, 07. november 2013
Juhendajad: vanemteadur, külalisprof, õppejõud Toomas Kivisild (Eesti Biokeskus, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Cambridge'i Ülikool) direktor, prof Richard Villems (Eesti Biokeskus, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Mari Järve „Erinevad geneetilised perspektiivid inimajaloole Euroopas ja Kaukaasias: lood, mida räägivad haploidsed ja autosomaalsed markerid“, Tartu, 11. juuni 2012
Juhendajad: direktor, prof Richard Villems (Eesti Biokeskus, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja vanemteadur Siiri Rootsi (Eesti Biokeskus)
- Tõnu Esko “Genotüpiseerimiskiibi andmete uudsed rakendused Euroopa geneetilise struktuuri analüüsil ning geneetilistes assotsiatsioonuuringutes”, Tartu, 19. oktoober 2012
Juhendaja: direktor, prof Andres Metspalu (TÜ Eesti geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Siim Sõber „Vererõhu geneetika: kandidaatgeenidest ülegenoomsete assotsiatsiooniuuringuteni“, Tartu, 04. mai 2011
Juhendajad: prof Maris Laan (TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja vanemteadur Tarmo Annilo (TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Tiit Nikopensius ”Mittesündroomsete suulõhede geneetiline eelsoodumus”, Tartu, 22. august 2011
Juhendaja: direktor, prof Andres Metspalu (TÜ Eesti geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Kristjan Välk “Mitteväikerakulise kopsuvähi kogu genoomi geeniekspressiooni- ja assotsiatsiooniuuringud”, Tartu, 25. august 2011
Juhendaja: direktor, prof Andres Metspalu (TÜ Eesti geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Signe Altmäe „Stimuleeritud ovariaalne follikulogenees: geneetiliste faktorite uuring“, Tartu, 29. jaanuar 2010
Juhendajad: direktor, prof Andres Metspalu (TÜ Eesti geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja vanemteadur Andres Salumets (TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Mari Nelis „Eesti populatsiooni geneetiline struktuur ja geneetiline kaugus teistest Euroopa päritolu populatsioonidest“, Tartu, 09. aprill 2010
Juhendaja: direktor, prof Andres Metspalu (TÜ Eesti geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Kaarel Krjutškov „Geenikiibil põhinev genotüpiseerimise meetod, APEX-2, kui paindlik lahendus DNA variatsioonide määramiseks“, Tartu, 04. mai 2010
Juhendaja: direktor, prof Andres Metspalu (TÜ Eesti geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Toomas Silla „Veise papilloomiviiruse tüüp 1 segregatsioonimehhanismi uurimine“, Tartu, 17. september
Juhendajad: prof Mart Ustav (TÜ tehnoloogiainstituu) ja erakorraline vanemteadur Aare Abroi (Eesti Biokeskus)
- Gyaneshwer Chaubey „India demograafiline ajalugu: pilt läbi geneetilise andmestiku“, Tartu, 20. september 2010
Juhendajad: vanemteadur Toomas Kivisild (Eesti Biokeskus) ja vanemteadur Ene Metspalu (TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Maarja Adojaan „HI-viiruse molekulaarne varieeruvus ja selle teadmise kasutamine vaktsiini väljatöötamisel“, Tartu, 17. detsember 2009
Juhendajad: direktor, erakorraline prof Richard Villems (Eesti Biokeskus, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja prof Mart Ustav (TÜ tehnoloogiainstituut)
- Janne Pullat "In situ sünteesitud oligonukleotiidide mikrokiibi disain, funktsionaliseerimine ja rakendamine", Tartu, 21. november 2008
Juhendaja: direktor, prof Andres Metspalu (TÜ Eesti geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Daima Örd "Uurimus stressi poolt indutseeritavast pseudokinaasist TRB3, transkriptsioonifaktori ATF4 uuest inhibiitorist", Tartu, 25. august 2008
Juhendaja: vanemteadur Tõnis Örd (Eesti Biokeskus) ja prof Jaanus Remme (TÜ molekulaar- ja rakubioloogia Instituut)
- Elin Lõhmussaar ”Alleelse aheldatuse (LD) struktuuri uurimine Euroopa opulatsioonides ja selle rakendused geneetilistes assotsiatsiooniuuringutes”, Tartu, 19. jaanuar 2006
Juhendaja: juhatuse liige, prof Andres Metspalu (Eesti Geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Mait Metspalu ”India eelajaloo käsitlus mtDNA vaatevinklis”, Tartu, 19. detsember 2005
Juhendaja: direktor, erakorraline prof Richard Villems (Eesti Biokeskus, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja erakorraline vanemteadur, prof Toomas Kivisild (Eesti Biokeskus, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Krista Kaasik ”Ööpäeva rütme tekitavate geenide roll imetajate bioloogilises kellas, ainevahetuses ja käitumises”, Tartu, 29. juuni 2005
Juhendajad: juhatuse liige, prof Andres Metspalu (Eesti Geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja Cheng Chi Lee, PhD (University of Texas Health Science Center-Houston)
- Kati Koido „22 kandidaatgeeni ühenukleotiidsete polümorfismide profiilide seos meeleolu- ja ärevushäiretega”, Tartu, 2005
Juhendajad: juhatuse liige,, prof Andres Metspalu (Eesti Geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut) ja vanemteadur Sulev Kõks (TÜ arstiteaduskond)
- Siiri Rootsi „Inimese Y-kromosomaalne varieeruvus Euroopa populatsioonides“, Tartu, 09. detsember 2004
Juhendaja: direktor, prof Richard Villems (Eesti Biokeskus, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Kristiina Tambets ”Inimese mitokondriaalse DNA haplogruppide jääajajärgsest levikust Euroopas ja kaugemal: fülogeograafiline analüüs”, Tartu, 18. juuni 2004
Juhendaja: direktor, prof Richard Villems (Eesti Biokeskus, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Tiina Kahre ”Tsüstiline fibroos Eestis”, Tartu, 14. mai 2004
Juhendaja: juhatuse liige, prof Andres Metspalu (Eesti Geenivaramu, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Neeme Tõnisson „Mutation detection by primer extension on oligonucleotide microarrays“, Tartu, 10. jaanuar 2003
Juhendaja: prof Andres Metspalu (TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Ade Kallas „VIII koagulatsioonifaktori vastaste antikehade iseloomustamine“, Tartu, 2002
Juhendajad: prof Hele Everaus (TÜ hematoloogia-onkoloogia kliinik) ja vanemteadur Margus Pooga (Eesti Biokeskus)
- Toomas Kivisild „Mitokondriaalse DNA varieerumine Lõuna- ja Lääne-Euraasia rahvastel ning nende päritolu“, Tartu, 09. mai 2000
Juhendaja: direktor, prof Richard Villems (Eesti Biokeskus, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Tarmo Annilo „Imetajate ribosoomivalk S7: homoloogsete geenide isoleerimine ning valgu lokalisatsioon rakus“, Tartu, 15. jaanuar 1999
Juhendaja: prof Andres Metspalu (TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Ana Rebane „Studies on Mammalian Ribosomal Protein S3a Genes and Intron-encoded Small Nucleolar RNAs U73 and U82“, Tartu, 24. november 1999
Juhendaja: prof Andres Metspalu (TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
- Jaanus Remme „Studies on the peptidyltransferase centre of the E.coli ribisome“, Tartu, 25. veebruar 1993
Juhendaja: direktor,, prof Richard Villems (Eesti Biokeskus, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut)
