NGS ehk järgmise põlvkonna sekveneerimine

NGS (Next Generation Sequencing) ehk järgmise põlvkonna sekveneerimine võimaldab järjestada nii väikseid DNA fragmente kui kogu genoomi. Genoomika tuumiklaboris on olemas Illumina sekvenaatorid - MiSeq, NextSeq500 ja NextSeq2000.

Missuguseid analüüse saame läbi viia?

  • Kogu genoomi resekveneerimine või de novo sekveneerimine
  • Transkriptoomi sekveneerimine (RNAseq, mRNAseq, miRNAseq)
  • DNA metülatsiooni analüüs
  • Valk-DNA interaktsioonide analüüs (ChIPseq)
  • Genoomi suunatud sekveneerimine
  • Eksoomi sekveneerimine
  • Amplikonide sekveneerimine

Masinad

MiSeq

MiSeq

Põhiliselt väiksemate genoomide (mikroorganismid) või amplikonide kiireks ja lihtsaks töötlemiseks.

NextSeq500

NextSeq500

Paindlik sekvenaator väikese ja keskmise suurusega projektide jaoks.

NextSeq2000

NextSeq2000

Suure ulatusega väga mitmekülgne sekvenaator, sobilik muuhulgas nii väikeste genoomide järjestamiseks, eksoomi-, transkriptoomi- kui ka ühe raku tasemel uuringuteks.

Geenivaramu tuur

Rootsi kuningapaari saatev äridelegatsioon külastas geenivaramut

Raivo Kolde

Tartu Ülikool osaleb andmepartnerina andmeanalüüsi ja tavaandmete uurimisvõrgustikus DARWIN EU®

2022 geeniteaduses

Loe ülevaadet 2022. aasta geeniteaduse olulisematest saavutustest