Skip to main content

NGS ehk järgmise põlvkonna sekveneerimine

NGS (Next Generation Sequencing) ehk järgmise põlvkonna sekveneerimine võimaldab järjestada nii väikseid DNA fragmente kui kogu genoomi. Genoomika tuumiklaboris on olemas Illumina sekvenaatorid - MiSeq, NextSeq500 ja HiSeq2500.

Missuguseid analüüse saame läbi viia?

  • Kogu genoomi resekveneerimine või de novo sekveneerimine
  • Transkriptoomi sekveneerimine (RNAseq, mRNAseq, miRNAseq)
  • DNA metülatsiooni analüüs
  • Valk-DNA interaktsioonide analüüs (ChIPseq)
  • Genoomi suunatud sekveneerimine
  • Eksoomi sekveneerimine
  • Amplikonide sekveneerimine

Masinad

MiSeq

MiSeq

Põhiliselt väiksemate genoomide (mikroorganismid) või amplikonide kiireks ja lihtsaks töötlemiseks.

NextSeq500

NextSeq500

Paindlik sekvenaator väikese ja keskmise suurusega projektide jaoks.

#muu

Eesti noorte teaduste akadeemiaga liitusid kolm genoomika instituudi teadlast

Eesti noorte teaduste akadeemia (ENTA) valis detsembri alguses toimunud üldkogul 13 uut liiget, kelle hulgas ka funktsionaalgenoomika teadur Erik Abneri, genoomika ja reproduktiivgeneetika

Jaga
09.12.2021
#muu
Maskiga klassis

Täida isiksusetest ja võrdle end „Kevade“ tegelastega

Jaga
08.12.2021
#muu

Personaalmeditsiin – teadusest praktikasse

3. detsembril toimub Tartus hübriid-vormis seminar “Personaalmeditsiin – teadusest praktikasse”.

Jaga
02.12.2021