NGS ehk järgmise põlvkonna sekveneerimine

NGS (Next Generation Sequencing) ehk järgmise põlvkonna sekveneerimine võimaldab järjestada nii väikseid DNA fragmente kui kogu genoomi. Genoomika tuumiklaboris on olemas Illumina sekvenaatorid - MiSeq, NextSeq500 ja HiSeq2500.

Missuguseid analüüse saame läbi viia?

  • Kogu genoomi resekveneerimine või de novo sekveneerimine
  • Transkriptoomi sekveneerimine (RNAseq, mRNAseq, miRNAseq)
  • DNA metülatsiooni analüüs
  • Valk-DNA interaktsioonide analüüs (ChIPseq)
  • Genoomi suunatud sekveneerimine
  • Eksoomi sekveneerimine
  • Amplikonide sekveneerimine

Masinad

MiSeq

MiSeq

Põhiliselt väiksemate genoomide (mikroorganismid) või amplikonide kiireks ja lihtsaks töötlemiseks.

NextSeq500

NextSeq500

Paindlik sekvenaator väikese ja keskmise suurusega projektide jaoks.

#instituudist #teadus
Ilustratsioon inimese evolutsioonist

Mainekas grant aitab Tartu Ülikoolis uurida inimese immuunsüsteemi kujunemist pika ajaloo vältel

#instituudist
#instituudist
Geenivaramu biohoidla

Eesti geenivaramu