-
Humanitaarteaduste ja kunstide valdkondJakobi 2, r 116-121 51005 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTJakobi 2 51005 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTJakobi 2, IV korrus 51005 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTJakobi 2, III korrus, ruumid 302-337 51005 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTÜlikooli 16 51003 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTLossi 3 51003 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTÜlikooli 18 50090 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTPosti 1 71004 Viljandi linn, Viljandimaa ESTJakobi 2 51005 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTJakobi 2 51005 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTSotsiaalteaduste valdkondLossi 36 51003 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTJakobi 5 51005 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTLossi 36, ruum 301 51003 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTNarva mnt 18 51009 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTNäituse 2 50409 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTNäituse 20 - 118 50409 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTLossi 36 51003 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTRaekoja plats 2 20307 Narva linn, Ida-Virumaa ESTRingi 35 80012 Pärnu linn, Pärnu linn, Pärnumaa ESTLossi 36 51003 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTLossi 36 51003 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTMeditsiiniteaduste valdkondRavila 19 50411 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTBiomeedikum, Ravila 19 50411 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTNooruse 1 50411 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTL. Puusepa 1a 50406 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTL. Puusepa 8 50406 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTRavila 19 50411 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTUjula 4 51008 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTRavila 50411 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTRavila 19 50411 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTLoodus- ja täppisteaduste valdkondVanemuise 46 - 208 51003 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTNarva mnt 18 51009 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTRiia 23b/2 51010 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTMäealuse 14 12618 Tallinn, Harjumaa ESTRavila 14a 50411 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTNarva mnt 18 51009 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTRiia 23, 23b - 134 51010 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTObservatooriumi 1 61602 Tõravere alevik, Nõo vald, Tartumaa ESTNooruse 1 50411 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTJ. Liivi tn 2 50409 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTNooruse 1 50411 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTVanemuise 46 51003 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTVanemuise 46 51003 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTRektori tegevusvaldkondÜlikooli 18 50090 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTTeadusprorektori tegevusvaldkondW. Struve 1 50091 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTÕppeprorektori tegevusvaldkondUppsala 10 51003 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTÜlikooli 18b 51005 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTÜlikooli 18a (III korrus) 51005 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTArendusprorektori tegevusvaldkondNarva mnt 18 51009 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTVanemuise 46 51003 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTÜlikooli 18, ruum 305 50090 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTLossi 25 51003 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTAkadeemilise sekretäri tegevusvaldkondUppsala 6, Lossi 36 51003 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTFinantsjuhi tegevusvaldkondÜlikooli 17 51005 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTJakobi 4 51005 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTKantsleri tegevusvaldkondUppsala 10 51003 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTÜlikooli 18A (III korrus) 51005 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTÜlikooli 18, ruumid 102, 104, 209, 210 50090 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa EST
23.11.2021
Lisateave
NGS ehk järgmise põlvkonna sekveneerimine
NGS (Next Generation Sequencing) ehk järgmise põlvkonna sekveneerimine võimaldab järjestada nii väikseid DNA fragmente kui kogu genoomi. Genoomika tuumiklaboris on Illumina sekvenaatorid - MiSeq ja NextSeq 2000, samuti Oxford Nanopore Technologies PromethION 2 Solo ning PacBio Revio pikkade järjestuste sekveneerimissüsteemid.
Missuguseid analüüse saame läbi viia?
- Kogu genoomi resekveneerimine või de novo sekveneerimine
- Transkriptoomi sekveneerimine (RNAseq, mRNAseq, miRNAseq)
- DNA metülatsiooni analüüs
- Valk-DNA interaktsioonide analüüs (ChIPseq)
- Genoomi suunatud sekveneerimine
- Eksoomi sekveneerimine
- Amplikonide sekveneerimine
Masinad
MiSeq
Põhiliselt väiksemate genoomide (mikroorganismid) või amplikonide kiireks ja lihtsaks töötlemiseks.
NextSeq 2000
Suure ulatusega väga mitmekülgne sekvenaator, sobilik muuhulgas nii väikeste genoomide järjestamiseks, eksoomi-, transkriptoomi- kui ka ühe raku tasemel uuringuteks.
Oxford Nanopore Technologies PromethION 2 Solo
Sekvenaator võimaldab sekveneerida genoome alates 10 000 kuni 100 000 nukleotiidi pikkuste järjestuste kaupa.
PacBio Revio
Sekvenaatorid võimaldavad sekveneerida genoome kuni 25 000 nukleotiidi pikkuste järjestuste kaupa.
