Skip to main content

NGS ehk järgmise põlvkonna sekveneerimine

NGS (Next Generation Sequencing) ehk järgmise põlvkonna sekveneerimine võimaldab järjestada nii väikseid DNA fragmente kui kogu genoomi. Genoomika tuumiklaboris on olemas Illumina sekvenaatorid - MiSeq, NextSeq500 ja HiSeq2500.

Missuguseid analüüse saame läbi viia?

  • Kogu genoomi resekveneerimine või de novo sekveneerimine
  • Transkriptoomi sekveneerimine (RNAseq, mRNAseq, miRNAseq)
  • DNA metülatsiooni analüüs
  • Valk-DNA interaktsioonide analüüs (ChIPseq)
  • Genoomi suunatud sekveneerimine
  • Eksoomi sekveneerimine
  • Amplikonide sekveneerimine

Masinad

MiSeq

MiSeq

Põhiliselt väiksemate genoomide (mikroorganismid) või amplikonide kiireks ja lihtsaks töötlemiseks.

NextSeq500

NextSeq500

Paindlik sekvenaator väikese ja keskmise suurusega projektide jaoks.

#instituudist
Jaga
02.03.2022
#instituudist
Geenivaramu biohoidla

Eesti geenivaramu

Jaga
29.11.2021
#instituudist
Applied Biosystems 3130xl Genetic Analyzer

Sangeri sekveneerimine ja kapillaarelektroforees

Jaga
23.11.2021