Illumina iScan System võimaldab kiibipõhist ülegenoomset genotüpiseerimist ja DNA metülatsiooni analüüsi. Genotüpiseerimise ja epigeneetilise analüüsi kiipide nimekiri on leitav Illumina kodulehelt.
Sagedasemat kasutust on tuumiklaboris leidnud järgnevad kiibid:
- Infinium Global Screening Array-24 (650 000 markerit) – võimaldab analüüsida korraga 24 proovi ühel kiibil. Sobib populatioonigeneetika, ülegenoomsete assotsiatsiooni uuringuteks ja polügeensete riskiskooride hindamiseks.
- Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx-8 (1 933 000 markerit) - võimaldab analüüsida korraga 8 proovi ühel kiibil. Sobib farmakogeneetilisteks uuringuteks ning polügeensete riskiskooride hindamiseks.
- Infinium CytoSNP-850K BeadChip (848 000 markerit) – võimaldab analüüsida korraga 8 proovi ühel kiibil. Sobib geneetiliste ja struktuursete muutuste analüüsimiseks.
- Infinium MethylationEPIC Array (930 000 metülatsiooni piirkonda) – võimaldab analüüsida korraga 8 proovi ühel kiibil. Sobib ülegenoomseteks epigeneetilisteks uuringuteks.
Proovide genotüpiseerimisse saatmisel palun täitke eelnevalt proovide nimekiri ning saatke aadressile corefacility@ut.ee.
Kui soovite täpsemat informatsiooni genotüpiseerimise protsessi, kiipide valiku ja vajamineva DNA koguse kohta palun kirjutage corefacility@ut.ee.